水火二將又稱「龜聖公、蛇聖公」，祀於鎮殿三上帝座前，為三上帝的「腳力」，分別為龜、蛇原形與將軍捧劍執印的法相。松柏嶺受天宮古時在天井溝渠處亦有蒼龜巨蛇棲息，隨環境開發，至今則偶見龜蛇出沒廟中。
水火二將原為遠古對北方玄武星宿「龜蛇交纏」崇拜的人格化，象徵宇宙間的坎離二炁，有守護陰陽交合的生殖崇拜之意。宋代《元始天尊說北方真武妙經》與《太上說玄天大聖真武本傳神咒妙經》都敘述「真武神將敬奉天尊教敕，乃披髮跣足，踏騰蛇八卦神龜，部領三十萬神將…齊到下方，七日之中天下妖魔一時收斷」，顯見道教的宇宙觀裡，玄武龜蛇的形象就是玄天上帝秉北方坎離二氣的幻化，之後更透過《玄天上帝啟聖錄》正式賦予「天關曰太玄火精含陰將軍赤靈尊神，地軸曰太玄水精育陽將軍黑靈尊神」的聖號。
關於玄天上帝收服龜蛇為部將還有一些神話：
(1)道經《太上說玄天大聖真武本傳神咒妙經注》記載，玄帝與六天魔王（水魔、火魔、旱魔、蝗魔、瘟魔、妖魔）戰于洞陰之野，魔王自恃坎（水）、離(火)二氣，幻化為蒼龜、巨蛇，變現方成，在與玄天上帝大戰時，被玄帝以神力躡於足下，不能變動，從此成為玄天上帝的腳力，變成玄天上帝的護法神
(2)神魔小說《北遊記》記載，真武在武當修行時，欲成仙道，但未去五藏之穢，妙樂天尊顯出神通，剖開他的肚子，將胃和腸挖出來，丟在岩石下，並將其肚子縫合。真武醒來自覺身輕，雜念全無，遂成仙道。而胃腸受了靈氣，年久月深，變為龜蛇二怪，在世上作惡害人，玄帝將其降伏後收為部將
(3)在稗官野史中提到玄天上帝出身的傳說，稱玄帝轉世為屠夫，因悔悟殺生太多，決心修道，遂自行切開腹肚，取出五藏丟在河裏洗淨。此舉感動上天，使他修成正果。但被他丟在河中的胃、腸，卻變成龜、蛇危害世人，後來玄天上帝將它們收服，鎮壓於腳底之下。當然小說故事，為道教人士所不取。玄天上帝足下的龜蛇二物，本來就是水火之精，又隨身侍衛左右，因此也就成為玄天上帝的象徵和代表，甚至是玄天上帝的化身，出現龜蛇多被當成是玄天上帝的顯靈，因此，古人自然就對龜蛇二物相對崇敬。
(4)龜將軍是玄天上帝左腳踩的神將部屬，法力高強。相傳玄天上帝喜歡宜蘭這個地方的特殊地理與風土人情，因此派遣他的得力特助，龜將軍化身龜山島在外海，蛇將軍化身蘭陽溪，共同守護宜蘭，龜蛇把海口。相傳，龜將軍人魚公主相戀，而她是海龍王最疼愛的小公主，公主怎麼可以和部屬相戀，可以嫁給更好的。但愛情來了，擋也擋不住。海龍王震怒，把龜將軍變成龜山島，人魚公主變成蘭陽平原的山，要他們兩個人天天遙望，卻天天、永不得相會。也傳說這對戀人常常流淚，也因此宜蘭平原經常下雨。
龜、蛇二將的形象特徵是：火精“真相赤蛇，變相青面、三目、金甲、兜鍪”；水精“真相玄龜，變相黑體、金甲、兜鍪”。明代武當山各宮玄帝殿內均有水火二將，明皇室奉送到武當山的神像中常有“火水一座”（即銅鑄鎏金的龜蛇交纏像），或“水一尊、火一尊”（當即具有人形特徵的水火二將站像）。
